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  • 新一代抗體發(fā)現(xiàn)平臺XploreSeq?——利用NGS和AI挖掘BCR免疫組庫,實(shí)現(xiàn)超快速抗體篩選

  • XploreSeq? 可分析數(shù)百萬個抗體序列并推薦高度多樣化的候選分子組合——準(zhǔn)確率超過50%

    • BCR免疫組庫規(guī)模龐大,包含許多具有成藥潛力的序列。一個典型的藥物發(fā)現(xiàn)項(xiàng)目可得到數(shù)百萬個BCR序列(如上所示)。

      XploreSeq?利用經(jīng)過多年訓(xùn)練和完善的AI引擎篩選該免疫組庫,識別苗頭抗體,輕松應(yīng)對這種大海撈針式的挑戰(zhàn)。

    • 重建抗體譜系樹(來自真實(shí)項(xiàng)目)

      候選抗體的質(zhì)量和多樣性都很重要。我們的目標(biāo)是從不同譜系中挑選具有高結(jié)合置信度和極佳可開發(fā)性的抗體。這將為整個項(xiàng)目提供多樣化的、可開發(fā)的苗頭抗體,可以覆蓋最大數(shù)量的表位,從而提高下游篩選的成功率。

  • 案例 1XploreSeq?高度準(zhǔn)確地識別苗頭抗體

    • 在該項(xiàng)目中,XploreSeq? 共預(yù)測了717個結(jié)合抗體,從中隨機(jī)選擇48個用于表達(dá)和測試。其中66.7%(32/48)被確認(rèn)為結(jié)合抗體,只有18.6%(6/32)的結(jié)合抗體與雜交瘤篩選的苗頭抗體重疊。

  • 案例 2將XploreSeq?應(yīng)用于VHH發(fā)現(xiàn)

    • 在該項(xiàng)目中,利用免疫噬菌體文庫以及Sanger測序共識別出41個獨(dú)特的VHH苗頭分子。

      隨后對文庫進(jìn)行NGS測序,并進(jìn)行XploreSeq? 分析。NGS結(jié)果包括之前識別出的41個苗頭分子中的38個。此外,XploreSeq? 還預(yù)測了43個新的VHH binder。表達(dá)和測試時,上述43個分子中的30個(69.7%)被確認(rèn)為是結(jié)合抗體,相比僅利用噬菌體展示獲得的苗頭抗體,其多樣性顯著提升。

  • 案例 3共同輕鏈雙抗的發(fā)現(xiàn)

    輕鏈在免疫組庫中的多樣性較低,因此更有可能在不同組庫中得到共同輕鏈,構(gòu)建共同輕鏈的雙特異性抗體。XploreSeq?非常適用于該應(yīng)用場景,可以采集數(shù)百萬個輕鏈序列,極大地提高了找到共同輕鏈的可能性。

    在本案例中,XploreSeq? 能夠在A抗原免疫組庫中識別出一條與我們通過XtraDoma? 雜交瘤平臺得到的B抗原的苗頭抗體類似的輕鏈。我們基于這兩條輕鏈直接構(gòu)建出了兩種共同輕鏈的雙特異性抗體。這兩種分子能被較好表達(dá)且純度高,并同時與兩個靶點(diǎn)結(jié)合。

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